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次世代シーケンス エクソーム解析

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特徴  サンプル条件  サービス内容  納品物  価格・納期  お見積もり・資料請求

 

特徴

 

シーケンス解析のターゲットをエキソンに絞り込むことにより、目的の遺伝子パネルに対して豊富なシーケンスデータを得ることができます。
エキソン領域の濃縮には、Agilent SureSelectシリーズ (*) を用います。

 

*Human All Exon V6 Kitなど最新のシリーズに対応しています。

 

“エクソーム解析"

 

サンプル条件

 

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

 

  • 高品質のゲノムDNAを5μg以上(濃度は25ng/μl以上)ご調製ください。
  • 核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
  • DNAサンプルはTEもしくは、市販DNA抽出キット付属の溶出液に溶解してください。
  • 電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
  • RNAのコンタミネーションがないことを確認してください(RNase処理を推奨)。
  • 冷蔵もしくは冷凍便にて送付してください。

 

サービス内容

 

  1. 受領したRNAサンプルについて、品質確認(サンプルQC)を行います。
  2. DNAを断片化します。
  3. 断片化したDNAにアダプターを付加します。
  4. Agilent SureSelectシリーズを用いてエキソン濃縮を行います(*)。
  5. 調製したライブラリーをシーケンシングします。
  6. (オプション解析)参照ゲノムにマッピングした後、変異箇所の抽出などの解析が可能です。

 

*ご希望のキットがございます場合はご相談ください。

 

納品物

 

エクソームシーケンシングデータのマッピング&変異解析

 

    解析なしの場合
  • シーケンシング配列データ(Rawデータ):FASTQ形式

    解析ありの場合
  • シーケンシング配列データ(クリーニング後):FASTQ形式
  • マッピング結果データ bam形式
  • 変異解析結果データ: vcf形式(例示の図表をご覧ください)

 

DNA-Seq データのマッピング&変異解析

 

価格・納期

 

エクソーム解析

 

  • サンプルQC、ライブラリ調製、出荷費用を含みます
  • Hiseq2500/2000  2×100bp (*1), 20Gb/total~
  • 納期 : 8~12週
  • 価格例(8サンプルの場合):16.5万円/sample (*2)

 

*1 2x125bpの場合の価格・納期についてはご相談ください。
*2 8サンプル以上から承ります。その他の条件につきましては、お問合せください。

 

 

お見積もり・資料請求

下記ボタンのリンク先ページに必要事項をご記入の上お申し込みください。

 

お見積り・資料請求

 


お問い合わせ

サービス詳細やご不明な点などお気軽にお問い合わせください。

 

ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンス プロダクトサポート
E-mail ngs-jp@eurofins.com
TEL 03-5492-7214

 

 

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HiSeq, MiSeqはIllumina社の、PacBio SequelはPacific Bioscience社の商標です。

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