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NGS / de novo ゲノム解析 (PacBio Sequel)

Service > NGS > denovo_genome_pacbiosequel
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特徴  サンプル条件  サービス内容  納品物  価格・納期  お見積もり・資料請求

 

特徴

 

PacBio Sequelは、従来のPacBio RSIIの平均 約7倍以上の高出力なシーケンシングです。
RSIIの従来の特徴(前処理のPCR増幅を行わない1分子によるリアルタイム(SMRT)解析や、20kbサイズを目安に可能な限り大きなライブラリサイズの調製)はそのままに、ゲノムサイズが大きな微生物でもde novoゲノム解析が行いやすくなりました。

 

  • データ量:1SMRT Cellあたり3-5Gb
  • 最大リード長:40kb以上
  • ライブラリサイズ:20kb

 

  • 高出力のSequelによるシーケンシング
    ゲノムサイズが大きな微生物でも利用しやすく!
    従来のRSIIで10セルが必要だった微生物では、Sequelを使うと3セルでシーケンス可能に!
  • 1分子によるリアルタイム解析
    前処理のPCRを伴わない1分子によるリアルタイム(SMRT)解析
  • 20kbサイズを目安に可能な限り大きなライブラリサイズ
    de novo ゲノム解析に最適

PacBio Sequel

 

サンプル条件

 

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

 

  • 高品質のゲノムDNAを20μg以上(濃度は100-300ng/μl)ご調製ください。
  • 核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
  • DNAサンプルはTEもしくは、市販DNA抽出キット付属の溶出液に溶解してください。
  • 電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
  • RNAのコンタミネーションがないことを確認してください(RNase処理を推奨)。
  • 冷蔵もしくは冷凍便にて送付してください。

 

サービス内容

 

  1. 受領したDNAサンプルについて、品質確認(サンプルQC)を行います。
  2. DNAを断片化後、BluePippinによるサイズセレクションを行います。
  3. 磁気ビーズによるDNA精製後、20kbを目安に可能な限り大きいインサートサイズのSMRT Bellライブラリ調製を行います。
  4. 調製したライブラリーをPacBio Sequel P6C4系 SMRT cellによりシーケンシングします。

 

※PacBio Sequel 次世代シーケンシングサービスは、リード数、リード長、総解析塩基数、データ品質、納期について、当社にて一切の保証をすることができません。

 

納品物

 

  • PacBio Sequelシーケンサの出力データ(BAM形式)
  • シーケンス結果のサマリーレポートファイル(PDF形式)

 

価格・納期

 

de novoゲノム解析(PacBio Sequel)

 

  • サンプルQC、SMRT Bellライブラリ調製、出荷費用を含みます
  • PacBio Sequel v2 chemistry
    20kbを目安として可能な限り大きいSMRT Bellライブラリ調製
    最大40kb/read, 1 SMRT Cell, 3-5Gb/total
  • バイオインフォマティックス解析:なし(※)

 

  • 参考価格 74万円(税別)
  • 納期 :10~12週

 

※現在は対応しておりません。

 

その他、詳細は「お見積もり・資料請求」よりお問合せ下さい。

 

 

お見積もり・資料請求

下記ボタンのリンク先ページに必要事項をご記入の上お申し込みください。

 

お見積り・資料請求

 


お問い合わせ

サービス詳細やご不明な点などお気軽にお問い合わせください。

 

ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンス プロダクトサポート
E-mail ngs-jp@eurofins.com
TEL 03-5492-7214

 

 

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HiSeq, MiSeqはIllumina社の、PacBio SequelはPacific Bioscience社の商標です。

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