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次世代シーケンス 16S メタゲノム解析

Service > NGS > 16S-rRNA
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特徴  サンプル条件  サービス内容  納品物  価格・納期  お見積もり・資料請求

 

特徴

 

細菌16S-rRNA アンプリコン解析
【細菌16S-rRNA × MiSeq】

 

メタゲノム解析として、細菌叢内の16S-rRNAの系統的シーケンスを行います。ゲノムDNAをサンプルとしてお預かりし、プライマー合成、 アダプターPCR、ライブラリプーリング、MiSeqシーケンシングまでのフルサポート解析を、好評のバリュープライスにて提供します。ランダム配列を含む当社独自のアダプターにより、クラスターパターンを最初に確定しアプリコンシーケンシングで見られる、Q値低下に対する改善を行っています。

細菌16S-rRNA V1-V3,V3-V4,V3-V5各領域に対応

 

サンプル条件

 

DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。

 

  • 精製された微生物ゲノムDNAを1μg 以上、濃度は10 ng/μl 以上にてご調製ください。
  • サンプルの品質は、解析結果に重大な影響を及ぼしますのでご注意ください。
    ※DNA量が多い場合でも、微生物由来のDNAの割合が少ない(宿主由来のDNAの割合が多い)場合は、PCRが上手く行かないことがあります。予めご了承ください。
    ※PCR不成功となり、やむを得ずプロジェクトを中止させて頂く場合にはPCR実施費用(1サンプルあたり¥9,000(税別))のみを頂戴いたします。
  • DNAサンプルはRNAのコンタミネーションが無いことをご確認ください。
  • DNAサンプルは、TEに溶解させた状態で冷蔵もしくは冷凍便にてお送りください。

 

サービス内容

 

  1. 受領したDNAサンプルについて、品質確認(サンプルQC)を行います。
  2. ご指定の領域をPCRにて増幅します。(弊社オリジナルのプライマーを用います)
  3. その後、アダプターを付加し、ライブラリーを調製します。
  4. 調製したライブラリーをMiSeqを用いて、ペアエンド法でシーケンシングします。
  5. 取得した配列を用いて、細菌叢のプロファイリングを行います。

 

納品物

 

16S rRNA アンプリコン シーケンシング後のバイオインフォマティックス解析

 

 

  • Rawデータ(FASTQ形式)
  • リードの OTU (クラスタリング) 解析
  • 各 OTUについての種分類解析 (BLAST)
  • 可視化データを含めた解析結果レポート
    を納品。

16S メタゲノム解析

 

価格・納期

 

16S rRNA メタゲノム解析

 

  • サンプルQC、PCR、ライブラリ調製、出荷費用を含みます
  • MiSeq  2×300bp, 平均16~18万リード/sample
  • 納期 : 7~9週

 

 項目  価格(税別価格)
6サンプル メタゲノム バリュ ープライス ¥180,000 /6サンプル
<種分類プロファイル +¥60,000>
8サンプル メタゲノム バリュープライス ¥240,000 /8サンプル
<種分類プロファイル +¥80,000>
12サンプル メタゲノム バリュープライス ¥360,000 /12サンプル
<種分類プロファイル +¥120,000>

 

 

お見積もり・資料請求

下記ボタンのリンク先ページに必要事項をご記入の上お申し込みください。

 

お見積り・資料請求

 


お問い合わせ

サービス詳細やご不明な点などお気軽にお問い合わせください。

 

ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンス プロダクトサポート
E-mail ngs-jp@eurofins.com
TEL 03-5492-7214

 

 

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HiSeq, MiSeqはIllumina社の、PacBioはPacific Bioscience社の、SureSelectはAgilent Technologies社の商標です。

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