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特徴
シーケンス解析のターゲットをエキソンに絞り込むことにより、目的の遺伝子パネルに対して豊富なシーケンスデータを得ることができます。
エキソン領域の濃縮には、Agilent SureSelectシリーズ (*) を用います。
*Human All Exon V6 Kitなど最新のシリーズに対応しています。
サンプル条件
DNAサンプルのご準備に際しての注意事項は以下の通りです。
- 高品質のゲノムDNAを5μg以上（濃度は25ng/μl以上）ご調製ください。
- 核酸定量は、蛍光測定法をお勧めします。サンプル量が規定量に満たない場合はご相談ください。
- DNAサンプルはTEもしくは、市販DNA抽出キット付属の溶出液に溶解してください。
- 電気泳動にてサンプルに分解がないことをご確認ください。
- RNAのコンタミネーションがないことを確認してください（RNase処理を推奨）。
- 冷蔵もしくは冷凍便にて送付してください。
サービス内容
- 受領したRNAサンプルについて、品質確認（サンプルQC）を行います。
- DNAを断片化します。
- 断片化したDNAにアダプターを付加します。
- Agilent SureSelectシリーズを用いてエキソン濃縮を行います(*)。
- 調製したライブラリーをシーケンシングします。
- （オプション解析）参照ゲノムにマッピングした後、変異箇所の抽出などの解析が可能です。
*ご希望のキットがございます場合はご相談ください。
納品物
エクソームシーケンシングデータのマッピング＆変異解析
解析なしの場合
- シーケンシング配列データ（Rawデータ）：FASTQ形式
解析ありの場合
- シーケンシング配列データ（クリーニング後）：FASTQ形式
- マッピング結果データ bam形式
- 変異解析結果データ： vcf形式（例示の図表をご覧ください）
価格・納期
エクソーム解析
- サンプルQC、ライブラリ調製、出荷費用を含みます
- NovaSeq6000 2×150bp
- 納期 ： 6～10週
- 価格：ご相談ください
お問い合わせ
サービス詳細やご不明な点などお気軽にお問い合わせください。
ユーロフィンジェノミクス株式会社
次世代シーケンス プロダクトサポート
E-mail ngs-jp@eurofins.com
TEL 03-6631-0106
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